包頭醫學院成立于1958年。作為新中國在邊疆民族地區較早建立的一所普通本科高等醫學院校，包頭醫學院在建校當年即招收五年制臨床醫學專業本科學生。1959年和1961年，包頭市衛生學校和內蒙古衛生干部進修學院先后并入包頭醫學院。2003年6月，教育部決定包頭醫學院與包頭鋼鐵學院、包頭師范學院合并組建內蒙古科技大學，2005年2月內蒙古自治區人民政府批準內蒙古科技大學分為三個具有獨立法人資格的辦學實體，學校冠名為內蒙古科技大學包頭醫學院。學校現有東河、青山兩個校區，學校占地面積70萬平方米，建筑面積30.19萬平方米。經過60多年的建設和發展，學校現已形成全日制本科教育、研究生教育、繼續教育和職業教育多層次辦學格局和以醫學為主，法學、教育學、文學、理學、管理學和工學協調發展的學科體系。1997年通過原國家教委本科教學工作合格評估，2008年在教育部本科教學工作水平評估中被評為“優秀”，2017年接受教育部本科教學工作審核評估，2020年通過教育部臨床醫學專業認證。學校設有研究生院、基礎醫學與法醫學院、公共衛生學院、護理學院、醫學技術與麻醉學院、口腔醫學院、藥學院、中醫學院、臨床醫學部、全科醫學院、人文與國際教育學院、馬克思主義學院、體育部、計算機科學與技術學院、衛生健康學院和繼續教育學院等16個教學單位。有附屬醫院15所，其中2所為直屬附屬醫院，教學醫院和實習醫院24所，社區衛生實踐基地11個。有預防醫學專業實踐教學基地38個、藥學專業實踐教學基地3個、法醫學專業實踐教學基地12個，還有其他專業實踐教學基地44個。學校面向19個省（自治區）招生，現有全日制在校生12069人，其中，碩士研究生1481人、本專科生9354人，其他各類學生1234人。開設28個本科專業，有國家級一流專業建設點1個，自治區一流本科專業建設點10個。自治區級品牌專業5個，自治區級重點建設專業2個。預防醫學專業為國家級特色專業建設點、教育部首批地方高等學校專業綜合改革試點。擁有國家級一流本科課程3門、自治區級一流本科課程18門。學校以學科建設為龍頭，教學科研并重，突出內涵式發展。自1980年開始招收碩士研究生，1986年獲批碩士學位授權單位。現有臨床醫學、基礎醫學、公共衛生與預防醫學、生物學、馬克思主義理論等5個一級學科碩士學位授權點，臨床醫學、公共衛生、藥學等3個碩士專業學位授權點。現有國家臨床重點專科1個，國家臨床重點專科建設項目2個；內蒙古自治區臨床重點建設專科1個，內蒙古自治區醫療衛生領先、重點學科9個，內蒙古自治區高等學校重點（培育）學科6個；包頭市醫療衛生領先、重點學科38個，包頭市醫療衛生重點培育學科9個。建有自治區人畜共患病與轉化醫學協同創新中心1個，自治區級重點（培育）實驗室9個。自治區級實驗教學示范中心5個，自治區工程（技術）研究中心8個，校級研究所（室）35個；自治區級創新團隊2個、校級創新團隊34個。學校師資力量雄厚，人才隊伍不斷壯大。現有教職工922人，專任教師548人，其中教授64人，副教授181人，博士研究生83名，專任教師中博士、碩士占比達85.77%。柔性引進5名學者作為特聘專家。教師隊伍中，享受國務院特殊津貼專家18人，國家百千萬人才工程1人，國家有突出貢獻中青年專家1人，國家級非物質文化遺產代表性傳承人1人，國家青年岐黃學者1人。內蒙古自治區突出貢獻專家16人，內蒙古自治區杰出人才獎3人，內蒙古自治區“新世紀321人才工程”人選31人，內蒙古自治區“草原英才”個人25人、團隊8個、工程青年創新創業人才7人，內蒙古自治區青年創新人才2人，內蒙古自治區“111”人才工程1人。內蒙古自治區高等學校教學名師獎獲得者12人、教壇新秀獎獲得者10人，內蒙古自治區級教學團隊12個。學校積極開展科學研究，先后獲得國家科技進步二等獎1項，華夏醫學科技二等獎1項，自治區級自然科學和科技進步獎22項（其中，自治區中青年科學技術創新獎1項、青年科學技術創新獎1項），自治區級、市級哲學社會科學優秀成果政府獎6項，中華護理學會科技獎1項，中國民族醫藥科技進步一等獎2項。近五年，學校承擔國家自然科學基金項目50項，其中，面上項目6項、青年項目2項、地區項目42項，自治區級科研項目666項；發表學術論文2679篇，出版學術著作164部；獲授權專利268項，其中發明專利22項。獲自治區高等教育教學成果獎8項。學校借助區位優勢，積極開展對外交流與合作。近年來先后與蒙古國國立醫科大學、泰國格樂大學等開展高層次人才培養和高水平科學研究；與北京大學牽手共建高水平公共衛生學院；與南京醫科大學、自治區綜合疾病預防控制中心、地方政府及中軟國際有限公司、朝聚眼科集團、內蒙古天奇中蒙制藥股份有限公司等開展戰略合作。學校積極履行社會責任，擔負衛生健康使命。深入推進產學研深度融合，為包頭市醫療和公共衛生事業發展、公共衛生應急體系建設提供重要支撐。依托專業特色和人才優勢，實施精準幫扶和鄉村振興。開展協同創新研究，提升科研資源開放共享廣度和深度。推動醫教研協同發展，全力打造區域醫療中心，努力構建一流的醫防服務體系。學校文化底蘊深厚，杰出校友人才輩出。建校以來，廣大教師和校友為國家經濟社會發展和進步作出重要貢獻。秦文斌教授在國內首次發現血紅蛋白A2現象，在國際上被稱為“秦氏現象”，于1978年出席全國科學大會榮獲先進科技工作者獎。以中國工程院院士董爾丹、高長青為代表的優秀校友，贏得社會各界和人民群眾的贊譽。7萬余名畢業生扎根祖國大地，為醫療衛生事業發展、守護人民生命健康默默奉獻，為當地經濟社會發展和進步做出了應有的貢獻。